जीवाणु एक कोशिकिय जीव है, जबकी विषाणु अकोशिकिय होता है। जीवाणु सुसुप्त अवस्था मे नहीं रहते है, जबकी विषाणु जीवित कोशिका के बाहर सुसुप्त अवस्था मे हजारों साल तक रह सकते है और जब भी इन्हें जीवित कोशिका मिलती है ये जीवित हो जाते है। जीवाणु बैक्टीरिया है, जबकी विषाणु वायरस हैं। विषाणु पर एन्टीबायोटिक दवाओं का असर नही होता है।